The domain linkers (bridges) and their phylogenetic profiles

Phylogenetic profiles (genomes list) are represented as strings of + and -, standing for presence and absence of the domain/combination in a genome, respectively; Move mouse to the colored symbols for the genome information (green, red and blue for Archaeal, Bacterial and Eukaryotic genomes respectively)

Bridge 1: (MMR_HSR1 -- KH_2)
MMR_HSR1 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + +
KH_2 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - - + + + + + +
MMR_HSR1 -- KH_2 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + - + + - + + + + + + + + + - + - - - - + + + - - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + - + + - + + + + + + + + + - + - - - - + + + - - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
view the linker in corresponding genomes Aae Ama Asp Asp2 Asp3 Atu Ava Bab Bab2 Ban Ban2 Ban3 Bap Bap2 Bap3 Bba Bbr Bbu Bce Bce2 Bce3 Bcl Bfr Bfr2 Bga Bha Bhe Bja Bli Blo Bma Bme Bpa Bpe2 Bps Bps2 Bqu Bsp Bsu Bsu2 Bth Bth2 Cac Cbu Cch Ccr Cdi Cef Cglu Chy Cje Cje2 Cje3 Cpe Cps Cte Cte2 Cvi Dar Dde Dps Dra Dvu Eca Eca2 Eco Eco2 Eco3 Eco4 Efa Eli Eru Eru2 Fnu Ftu Gka Gme Gox Gsu Gvi Hdu Hhe Hin Hin2 Hpy Hpy2 Ilo Lac Lin3 Ljo Lla Lmo Lmo2 Lpl Lpn Lpn2 Lpn3 Lsa Lxy Mbo Mca Mfl Mga Mge Mhy Mhy2 Mhy3 Mle Mmo Mmy Mpa Mpe Mpn Mpu Msu Msy Mtu Mtu2 Neu Nfa Ngo Nme Nme2 Nmu Noc Nwi Oih Oye Pac Pae Par Pca Pfl Pfl2 Pgi Pha Plu Plu2 Pma Pma2 Pma3 Pma4 Pma5 Pmu Ppr Ppu Psy Psy2 Psy3 Rco Reu Rfe Rlo Rme Rpa Rpr Rso Rsp Rty Sag Sag2 Sag3 Sau Sau2 Sau3 Sau4 Sau5 Sau6 Sau7 Sav Sbo Sch Sco Sdy Sel Sep Sep2 Sfl Sfl2 Sha Smu Son Spa Spn Spn2 Spom Spy Spy2 Spy3 Spy4 Spy5 Spy6 Spy7 Ssa Sso Ssp Ssp2 Ssp3 Ssp4 Ssp5 Ssp6 Sth2 Sth3 Sth Sty Sty2 Sty3 Tcr Tde Tde2 Tde3 Tfu Tma Tpa Tte Tth Tth2 Twh Twh2 Upa Vch Vfi Vpa Vvu Vvu2 Wpi Wsp Wsu Xax Xca Xca2 Xca3 Xfa Xfa2 Xor Ype Ype2 Ype3 Yps Zmo Ath
Bridge 2: (CBS -- SIS)
CBS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + + + + + + + + +
SIS + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + - + + + - + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
CBS -- SIS - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - + + - - - - - + - - - - + + - - + + + + + + + + + - + - - + - + + + + - - - - + + - + - + + + + + + - + + + + + - + - - + - + + + + + - - - - + + - + + + - + + + + + + + - + + - - - - - - + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - + + + - + + - - - + + + + + - + + + - - - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - + + - - - - - - - - - - + + - - + + + - + + + + + - + - - - - + - + + - - - - + + - - - - - - - + + - - - + + + - + - - + - + + + + + - - - - + + - - + - - + + + + - - + - + + - - - - - - + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - + + + - + + - - - + + - + + - + + + - - - + - + + + - + + + + + - + - + + + - + + - - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 3: (GATase_2 -- SIS)
GATase_2 + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + - + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + +
SIS + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - + + + + - + + + - + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
GATase_2 -- SIS - + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + - - - - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + - + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + - + + - + + - - - - - - - + - - - - - - - - - - - + - - + + + - + + + - + - + - - - - + - + + - - - - + + - - - - - - - + + - - - + + + - + - - + - + + + + + - - - - - + - - + - - - - - - - - + - + + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + - - - + + - + + - + + + - - - + - - + + - + + + + + - + - + + + - + + - - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + - - - - + + + + + + - - - - - - - - - - + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 4: (CBS -- ABC_tran)
CBS + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + + + + + + + + +
ABC_tran + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +
CBS -- ABC_tran - - - - + + - - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + + - - - - + - + + + + - + + - - - - + - + + + - + + + - + + + + + - + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - + - + - + - - + - + + + + + + - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - + - + + - - + + - - - + - - - - - - + + - + + + + - - + - - + - - + + - + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + - - - + + + + + + + + + - - - - - - - + - + + + - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + + - - - - + - + - - + - + + - - - - + - + + + - + + + - + + + - + - + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - + - + - + - - + - + + + + + + - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + - + + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - + - + + - - + + - - - + - - - - - - + + - + + + + - - - - - + - - + + - + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + - - - + + + + + + + + + - - - - - - - + - + + + - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 5: (HD -- KH_1)
HD + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + - - - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + - + - + + + + +
KH_1 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + - + + + + - + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + +
HD -- KH_1 - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - + + + - - - + - + + + + + - + + + + - - + - - - - - - - - - - + - + + - + - - + - - - - + + + - - + - - - - - + + - - - - + + + + + + - - - - - - + - - - + - + + - + - - + - - + + - + - - + + + + + + - - - + - - - + + - - - - - - + - + - - - - - - - - - - - - - - + + + - - + - - + - + - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + - - - - - - + + - - + + - - + + - + + + + + + + + - - - - - - - + + + - - - - - + + + + + + + + - - + - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - + + + - - - + - + + + + + - + + + + - - + - - - - - - - - - - + - + + - + - - + - - - - + + + - - + - - - - - + + - - - - + + + + + + - - - - - - + - - - + - + + - + - - + - - + + - - - - + - + + + - - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + + + - - + - - + - + - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + - - - - - - + + - - + + - - + + - + + + + + + + + - - - - - - - + + + - - - - - + + + + + + + + - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 6: (tRNA_bind -- tRNA-synt_1)
tRNA_bind + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
tRNA-synt_1 + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
tRNA_bind -- tRNA-synt_1 + - - - - - + - + - - - - + - + + + - - - - - - - - - - + - - - - + + + - - - - + - + + + + - - - - + - - + - + - + - + + + - + + - + - - + - - - - - - - + + + - - + - - - - + - + - - - + + - + + - + - + + + + + + - - - + + + - - - - + + + + + + - + - - + + + + + + - - - + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + + - + - - - - - - - - - - + - - - - - + + - - - - - - - - + - - - - - + - - + + + + + + + + + + - + + - + - + + + + + + - + + + - + + + + + + + + + - - - - - - + + + + + + - - + - - + - + + + - - - + + + + + - - - + - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + - - - - + - + + + + - - - - + - - + - + - + - + + + - + + - + - - - - - - - - - - + + + - - - - - - - - - - - - - - + - + + - + - + - - - - + - - - + - + - - - - - - - - + + - + - - + + + + + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - + - - - - - + + - - - - - - - - + - - - - - + - - + + + + + + + + + + - - - - + - + + - - + + - - + + - + + + + + + + + - - - - - - - + + + - - - - - + - - - - + - - - - - - - + - - - - - + - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 7: (HRDC -- 3_5_exonuc)
HRDC - - - - + + - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + - - - + + - + + + + - + + - - + + + + + + + - + + + + + + + + + - + + - + + + + + - - - + - + - - - - + - + - - + + + - + + - - - + + + + + + + - - + + - + + + + + - + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + - + + + + - - - + - + + + + + + + + + + - - - - - + + + - + + + - + - + - + + + - + + - - - - + + + + + + + + + + + + - + + + + + - + + - - + - - - - - - - + + - - - - - - - - - + + + + + + + + - - - - - + + - + + + + + - - - - + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + - + - + + + + + - - - - + + + + +
3_5_exonuc - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + + + + + + + - - - - - - - + + - - - - - + + + - + + - + + + + + + + + + + - + - + - + + + + + + + + - + + + - - + + + + + + + - - + + + + + - + + + + + + + + - + + + - + - + + + + + + + + - - + - + + - - - - - - + + + - + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - + - + + + + + + + + + + + - - + + + - + + - - + - - - - - - - - + + + + + + + - + - + + + + + + + + + + - - - + + - + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - - - + + + + + + - + - + + + + +
HRDC -- 3_5_exonuc - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - + - + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - + - + - - - - - + - - + - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - + - - - - - - - - + - - - - + + + + + - + - - - + - + + + - + - + + - - + - + + - - - - - - - - - - + + + - - - - - - + - - + - - - + - + + - + - - - - - - - - + + + + + + - + - + - - - - - + + + - + + + - + - - - + + + - - + - - - - - - - - - - - + + + + + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + - - - - - - - - - + + + + - - - + - - - - - + + - - - - + + - - - - - - - - - - - + + + + + - + + - + + + + + + + - - - + + + + + - - - - + + + + +
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - + + + - + - + - - - - - + + + - + - + + - - + - + + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - + - + + + - + - + - - - - - + + + - + + + - + - - - + + + - - + - - - - - - - - - - - - + + - + - - - + + - - + + - - + - - - - - - - - + - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - + + - - - - - - - - - - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 8: (HD -- tRNA_anti)
HD + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + - - - + + + + + + + - + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + - - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + - + + + + + + - + - + + + + +
tRNA_anti + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + - + + + + + + - + + + + + + +
HD -- tRNA_anti - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + - - - + - - + + + + - - - - + - - + - - - - - - - - - - + - + - - + - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - - - + - + - - + - - - - - - + - - - - - + + - + - - - - - - - - + - - + + + + + + - - - + - - - + - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + - - - - - - + + - - + + - - + + - + + + + + + + + - - - - - - - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
Is the connection a bridge? - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + + + - - - + - - + + + + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - + - - - - - - - - - + - - - - - + - - + - - - - - - - - + - - + + + + + + - - - + - - - + - - - - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - + - - - - - - - - - - + + + + + + + + + + - - - - - - + + - - + + - - + + - - - + - + + + + - - - - - - - + - + - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
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Bridge 9: (AA_kinase -- Acetyltransf_1)
AA_kinase + + + + + + + + + + + - + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + + +